Protein–RNA interactions for Protein: Q8K099

Lrit1, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit1Q8K099 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrit1Q8K099 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrit1Q8K099 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrit1Q8K099 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
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