Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP86

Snapc4, snRNA-activating protein complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc4Q8BP86 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Snapc4Q8BP86 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Snapc4Q8BP86 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Snapc4Q8BP86 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms