Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem260Q8BMD6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Tmem260Q8BMD6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem260Q8BMD6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms