Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Rtl1Q7M732 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Rtl1Q7M732 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rtl1Q7M732 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rtl1Q7M732 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rtl1Q7M732 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Rtl1Q7M732 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rtl1Q7M732 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Rtl1Q7M732 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms