Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY1

Fchsd1, F-BAR and double SH3 domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd1Q6PFY1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Fchsd1Q6PFY1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fchsd1Q6PFY1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd1Q6PFY1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd1Q6PFY1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd1Q6PFY1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd1Q6PFY1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fchsd1Q6PFY1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms