Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nlrp9cQ66X01 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nlrp9cQ66X01 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms