Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Foxd1Q61345 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Foxd1Q61345 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd1Q61345 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms