Protein–RNA interactions for Protein: Q5TID7

CCDC181, Coiled-coil domain-containing protein 181, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC181Q5TID7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CCDC181Q5TID7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC181Q5TID7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms