Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trappc1Q5NCF2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trappc1Q5NCF2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trappc1Q5NCF2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
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