Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZCX4

ZNF568, Zinc finger protein 568, humanhuman

Predictions only

Length 644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF568Q3ZCX4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ZNF568Q3ZCX4 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ZNF568Q3ZCX4 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms