Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pacs2Q3V3Q7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Pacs2Q3V3Q7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.5 ms