Protein–RNA interactions for Protein: Q3UX49

C87499, Expressed sequence C87499, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C87499Q3UX49 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
C87499Q3UX49 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
C87499Q3UX49 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C87499Q3UX49 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C87499Q3UX49 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
C87499Q3UX49 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87499Q3UX49 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
C87499Q3UX49 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms