Protein–RNA interactions for Protein: Q3UST5

UPF0764 protein C16orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UST5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Q3UST5 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3UST5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3UST5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3UST5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Q3UST5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Q3UST5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Q3UST5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Q3UST5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Q3UST5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Q3UST5 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms