Protein–RNA interactions for Protein: Q3URJ8

Nkain3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain3Q3URJ8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Nkain3Q3URJ8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Nkain3Q3URJ8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms