Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy4Q3TYX8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rufy4Q3TYX8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rufy4Q3TYX8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rufy4Q3TYX8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms