Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TchpQ3TVW5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TchpQ3TVW5 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms