Protein–RNA interactions for Protein: Q38HM4

Trim63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim63Q38HM4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trim63Q38HM4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trim63Q38HM4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 150.3 ms