Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RIGQ13278 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RIGQ13278 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RIGQ13278 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms