Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 YOL029CYOL029C 606 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 SPC29YPL124W 762 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 MFB1YDR219C 1398 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 NSA1YGL111W 1392 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 VPS53YJL029C 2469 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YPL109CYPL109C 1974 nt4.22□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 RDS1YCR106W 2499 nt4.21□□□□□ -1.73
CLF1Q12309 YAP6YDR259C 1152 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RMD6YEL072W 696 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YER034WYER034W 558 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MXR1YER042W 555 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MIX23YBL107C 591 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MTL1YGR023W 1656 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 CUE3YGL110C 1875 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 LRG1YDL240W 3054 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 CDC37YDR168W 1521 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RRN7YJL025W 1545 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YLR446WYLR446W 1302 nt4.21□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 TDA1YMR291W 1761 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 DBP3YGL078C 1572 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 UBX3YDL091C 1368 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 DPP1YDR284C 870 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YJR087WYJR087W 351 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YKR011CYKR011C 1062 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YAR075WYAR075W 474 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 ATG2YNL242W 4779 nt4.2□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 FMP25YLR077W 1752 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 GYP6YJL044C 1377 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RPS14AYCR031C 414 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 GIM4YEL003W 336 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 TMA20YER007C-A 546 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RGI1YER067W 486 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MIG2YGL209W 1149 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YGR042WYGR042W 816 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YGR051CYGR051C 324 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 IRC9YJL142C 393 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YLR050CYLR050C 486 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 GIM3YNL153C 390 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YBR090CYBR090C 369 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 ENP2YGR145W 2124 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 AI4Q0065 1671 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 NTH1YDR001C 2256 nt4.19□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 ACK1YDL203C 1872 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 PRM15YMR278W 1869 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 snR84snR84 550 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RPB3YIL021W 957 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 ATP11YNL315C 957 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RPS10AYOR293W 318 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MRPS9YBR146W 837 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 TSR1YDL060W 2367 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt4.18□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 VID27YNL212W 2349 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YOL019WYOL019W 1656 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 VPS17YOR132W 1656 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YDR491CYDR491C 492 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MAM1YER106W 909 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YAP5YIR018W 738 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 SEN15YMR059W 387 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 IMP1YMR150C 573 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YMR254CYMR254C 309 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YNL109WYNL109W 546 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RXT2YBR095C 1293 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 snR24snR24 89 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 ABP140YOR239W 1887 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MYO3YKL129C 3819 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 SLF1YDR515W 1344 nt4.17□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 FUN12YAL035W 3009 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YKL050CYKL050C 2769 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 NRP1YDL167C 2160 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YGL082WYGL082W 1146 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YGL108CYGL108C 423 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YGL159WYGL159W 1113 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YJL114WYJL114W 681 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YJL133C-AYJL133C-A 225 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 TMA19YKL056C 504 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 FYV7YLR068W 456 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 YPL205CYPL205C 345 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 NGG1YDR176W 2109 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 RPB2YOR151C 3675 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 NOP56YLR197W 1515 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 BUD27YFL023W 2391 nt4.16□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 MTC4YBR255W 2085 nt4.15□□□□□ -1.74
CLF1Q12309 HOM2YDR158W 1098 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 LOC1YFR001W 615 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YIL161WYIL161W 708 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YJR020WYJR020W 333 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 GLO1YML004C 981 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 GRX7YBR014C 612 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 ZDS2YML109W 2829 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 SMI1YGR229C 1518 nt4.15□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YLR177WYLR177W 1887 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 HEF3YNL014W 3135 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 VMA21YGR105W 234 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 QCR10YHR001W-A 234 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 IRC18YJL037W 675 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 AIM26YKL037W 357 nt4.14□□□□□ -1.75
CLF1Q12309 YLR406C-AYLR406C-A 150 nt4.14□□□□□ -1.75
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