Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Siah2Q06986 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Siah2Q06986 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms