Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Defb1P56386 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defb1P56386 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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