Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CratP47934 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CratP47934 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CratP47934 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CratP47934 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CratP47934 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CratP47934 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CratP47934 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CratP47934 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CratP47934 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CratP47934 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CratP47934 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CratP47934 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms