Protein–RNA interactions for Protein: P31310

Hoxa10, Homeobox protein Hox-A10, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa10P31310 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxa10P31310 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxa10P31310 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms