Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lama1P19137 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lama1P19137 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Lama1P19137 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms