Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Spi1P17433 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Spi1P17433 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Spi1P17433 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms