Protein–RNA interactions for Protein: P09405

Ncl, Nucleolin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NclP09405 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NclP09405 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NclP09405 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NclP09405 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NclP09405 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NclP09405 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
NclP09405 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NclP09405 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.57■■■□□ 2
NclP09405 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NclP09405 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NclP09405 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NclP09405 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NclP09405 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NclP09405 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NclP09405 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NclP09405 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC27.56■■■□□ 2
NclP09405 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NclP09405 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
NclP09405 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NclP09405 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NclP09405 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NclP09405 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NclP09405 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NclP09405 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NclP09405 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
NclP09405 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NclP09405 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NclP09405 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NclP09405 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NclP09405 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NclP09405 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NclP09405 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NclP09405 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NclP09405 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms