Protein–RNA interactions for Protein: P01725

Ig lambda-1 chain V region S178, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01725 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01725 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01725 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P01725 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
P01725 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01725 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01725 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01725 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms