Protein–RNA interactions for Protein: O88554

Parp2, Poly [ADP-ribose] polymerase 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp2O88554 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Parp2O88554 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Parp2O88554 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Parp2O88554 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Parp2O88554 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp2O88554 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms