Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM4AO75164 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM4AO75164 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms