Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vamp4O70480 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vamp4O70480 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vamp4O70480 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms