Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chil3O35744 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chil3O35744 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Chil3O35744 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms