Protein–RNA interactions for Protein: O35253

Smad7, Mothers against decapentaplegic homolog 7, mousemouse

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Length 426 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad7O35253 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Smad7O35253 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Smad7O35253 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Smad7O35253 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms