Protein–RNA interactions for Protein: L7N471

Gm7980, Predicted gene 7980 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7980L7N471 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm7980L7N471 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm7980L7N471 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms