Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Mfsd4b4J3QNS5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd4b4J3QNS5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms