Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20425E9Q035 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20425E9Q035 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms