Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Col9a3A2ACT7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Col9a3A2ACT7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms