Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Knop1Q9Z2Q2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Knop1Q9Z2Q2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Knop1Q9Z2Q2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms