Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ubl3Q9Z2M6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ubl3Q9Z2M6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms