Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR5

Cdh13, Cadherin-13, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh13Q9WTR5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cdh13Q9WTR5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cdh13Q9WTR5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms