Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKY0

PRND, Prion-like protein doppel, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNDQ9UKY0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
PRNDQ9UKY0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PRNDQ9UKY0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms