Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
SCN11AQ9UI33 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SCN11AQ9UI33 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms