Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Plod3Q9R0E1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Plod3Q9R0E1 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms