Protein–RNA interactions for Protein: Q9R013

Ctsf, Cathepsin F, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsfQ9R013 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CtsfQ9R013 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CtsfQ9R013 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms