Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

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Length 557 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpc1Q9QZF2 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gpc1Q9QZF2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Gpc1Q9QZF2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gpc1Q9QZF2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Gpc1Q9QZF2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gpc1Q9QZF2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gpc1Q9QZF2 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms