Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Lsm4Q9QXA5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lsm4Q9QXA5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms