Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Bco1Q9JJS6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Bco1Q9JJS6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Bco1Q9JJS6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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