Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS3

Smco4, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco4Q9JIS3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Smco4Q9JIS3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Smco4Q9JIS3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Smco4Q9JIS3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms