Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ms4a4bQ9ES61 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ms4a4bQ9ES61 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms