Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Slc46a3Q9DC26 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slc46a3Q9DC26 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms