Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ccdc3Q9D6Y1 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc3Q9D6Y1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms